Vaikų ligų skyriuje dirba vaikų ligų gydytojai ir vaikų slaugytojai. Skyriuje pagalba teikiama visą parą. Esant reikalui mažuosius pacientus konsultuoja kitų specialybių gydytojai. Per metus Vaikų ligų skyriuje gydosi iki 950 ligonių. Sunkių būklių atvejais vaikai pirmosios pagalbos teikimui stacionarizuojami Reanimacijos ir intensyvios terapijos skyriuje. Labai sunkios būklės ligoniai Šiaulių ligoninės vaikų reanimobiliu vežami gydyti į Šiaulių apskrities ligoninės Vaikų reanimacijos ir intensyvios terapijos skyrių ar Kauno medicinos universiteto klinikas, Vilniaus Universiteto ligoninės Santariškių Klinikas. Vaikų ligų skyriuje tiriami ir gydomi iki 18 metų amžiaus ligoniai, sergantys šių sistemų ligomis:
  • Kvėpavimo sistemos;
  • Virškinimo sistemos;
  • Inkstų iršlapimo takų;
  • Jungiamojo audinio ir skeleto - raumenų;
  • Širdies ir kraujagyslių ligos ir sindromai;
  • Neurologinės ligos ir sindromai;
  • Odos;
  • Endokrininės sistemos.
Vaikų ligų skyriuje atliekami tyrimai:
  • Bendri klinikiniai ir biocheminiai laboratoriniai tyrimai;
  • Organizmo terpių pasėliai (kraujo, šlapimo, likvoro), jų mikrobiologinis ištyrimas ir antibiotikogramos nustatymas;
  • Radiologinis ištyrimas;
  • Echoskopiniai tyrimai - pilvo organų, skydliaukės, širdies ir kt.;
  • Endoskopiniai tyrimai (gastrofibroskopijos, kolonoskopijos, rektoskopijos, bronchoskopijos);
  • Spirometrija (plaučių tūrio tyrimas);
  • Elektroencefalografinis tyrimas (galvos smegenų funkcijos tyrimas).